Bachelor Information System (BCIS) merupakan kelas internasional prodi Sistem Informasi. Mahasiswa yang tergabung dalam kelas ini, dimungkinkan mendapat pengajaran dan pembelajaran bersama mahasiswa dari negara lain. Kapasitas ruang dan jumlah mahasiswa dibuat terbatas. Kelebihan dari memilih kelas ini yaitu mahasiswa dapat lebih fokus dalam belajar dan memperoleh perhatian lebih dari dosen sehingga proses belajar mengajar di kelas terjalin efektif.
Kelas Reguler merupakan kelas yang dapat diikuti oleh calon mahasiswa pada umumnya. Calon mahasiswa SMA maupun SMK dengan jurusan non komputer dapat memilih program ini jika memenuhi syarat. Kapasitas dan jumlah mahasiswa yang diterima relatif banyak sehingga kelebihan dari kelas ini yaitu mahasiswa dapat memperoleh banyak relasi dari satu angkatan program studinya.
Program transfer diperuntukkan bagi mahasiswa yang sebelumnya telah pernah menjalani perkuliahan diploma-3 (D3) dan hendak melanjutkan ke jenjang Strata-1. Khusus program transfer maksimal masa studi yaitu selama 3 semester (1,5 tahun) dan maksimal 4 semester (2 tahun). Disarankan memiliki latar belakang jurusan yang sama (komputer) karena biasanya akan dilakukan proses konversi sks matakuliah yang telah ditempuh selama menjalani jenjang D3. Bagi mahasiswa yang telah mengambil D3 jurusan Manajemen Informatika Universitas Amikom sangat disarankan untuk mengambil S1 pada program studi Sistem Informasi ini karena memiliki mata kuliah yang relatif sama sehingga proses perkuliahan biasanya tidak memerlukan waktu yang lama.
